制藥廢水主要來源于中藥材前處理的清洗、蒸煮，提取工藝中的提煉、濃縮，以及殘液傾倒、設備清洗過程等，該廢水濃度很高，可生化性很差，一般廢水處理設施已不能滿足廢水處理的要求。

   基本處理流程：原水由排水渠道經預沉池、格柵去除水中的漂浮物、長纖維物后自流進入調節池，調節水量后由泵提升進入溶氣氣浮，在氣浮裝置前投加PAC、PAM，經絮凝后混合液流入氣浮中，驟然減壓釋放的無數微細的過飽和氣體與“礬花”及水中懸浮類結合浮上水面形成浮渣，刮渣機定期將浮渣刮去，浮渣順管道排入污泥濃縮池。分離去除污染物后的廢水進入微電解絮凝槽，微電解絮凝槽反應機理較為復雜，而且本身內部發生一系列物理化學作用。基本認為當有一定電位差的鑄鐵屑浸沒在廢水溶液中，廢水充當電解質，構成無數個電池回路，在它的表面有電流流動，產生電極反應和由此引起的一系列作用，改變廢水中污染物的性質，從而達到廢水處理的目的。經微電解絮凝槽反應后的廢水進入厭氧反應器中，厭氧反應器主要是通過厭氧顆粒微生物對制藥廢水中的好氧生化難以降解的有機物進行厭氧降解，通過厭氧微生物的作用可使長鏈的大分子降解為短鏈的小分子，從而降低了廢水中的有機物含量，提高了廢水的可生化性，為后續處理提高了有利的保證，厭氧反應器處理后的廢水進入接觸氧化池，在接觸氧化池中，設置了具有極大表面積的彈性立體彈性填料，可以附著生長大量的具有活性的生物膜，不斷曝氣形成好氧生物作用環境，生物作用使小分子的有機物被分解。經接觸氧化池處理后自流進入二沉池，二沉池主要為了沉淀接觸氧化池內的如細菌、雜質、纖維、氧化池脫落的和老化的生物膜，以達到泥水分離的目的，還將沉降下來的污泥排至污泥池；二沉池出水進入集水池，由提升泵提升至過濾器進行深度處理，處理后進入脫色池達標排放，過濾器反沖洗水源利用脫色池內達標的廢水。